Родился 12 (24) января 1873 года в Москве в семье врача-окулиста. Получил первоначальное домашнее образование в доме деда-священника. Затем в 1882 году Дмитрий Ушаков поступил в подготовительный класс Первой московской шестиклассной прогимназии, а в 1889 году – в седьмой класс Пятой московской гимназии.
В 1895 году он окончил историко-филологический факультет Московского университета с дипломом 1-й степени. Первоначально занялся преподаванием в средней школе. В 1900-1901 годах он сдал магистерские экзамены.
